Flows

Geolog Integration

O Módulo Geolog Integration foi desenvolvido para estabelecer uma conexão eficiente com o software Geolog, facilitando a importação e exportação de dados de image log entre os softwares. Para seu pleno funcionamento, é necessário o uso do Python 3.8 no Geolog, uma vez que esta versão inclui bibliotecas essenciais para a integração.

Painéis e sua utilização

Lendo um projeto do Geolog

Widget responsável por verificar se o Geolog está disponível e ler um projeto do Geolog, verificando WELLS, SETS e LOGS disponíveis.


Figura 1: Widget de conexão ao Geolog.

Geolog directory: Diretório do local de instalação do Geolog.
Projects directory: Diretório da pasta com o projeto que é desejado ler.
Project: Seletor de projetos disponíveis dentro do diretório. Caso necessário, o botão ao lado atualiza o seletor para mostrar novos projetos.

Importando dados do Geolog

Widget responsável por mostrar dados disponíveis para importação do Geolog para o Geoslicer.


Figura 2: Widget de importação de dados do Geolog.

Null values list: Lista de valores considerados como nulos. Durante a importação das imagens, é realizada uma verificação para identificar se esses valores estão presentes. Caso estejam, as imagens passam por um processo de tratamento apropriado.
Well diameter: Diâmetro do poço (polegadas). Usado no cálculo do tamanho dos pixels e atributos do volume criado.
Well name: Nome do poço no Geolog. Contém os SETS e LOGS a serem importados.
Seletor: Após conectar e selecionar um poço, os dados disponíveis (LOGS) para serem importados serão exibidos aqui.

Exportando dados para o Geolog

Widget responsável por selecionar e exportar dados de imagelog do Geoslicer para o Geolog.


Figura 3: Widget de exportação de dados para Geolog.

Choose a well: Seletor de Poços disponíveis no projeto do Geolog. Selecionar a opção "New Well" irá criar um novo poço durante a exportação, com o nome digitado no campo ao lado.
Choose a set: Campo para digitar nome do SET em que será salvo os dados. SETs não podem ser modificados e escolher um SET que já existe pode sobrescrever os dados se a opção ao lado estiver selecionada.
Seletor: Seletor de dados do Geoslicer para serem exportados. Devido a forma que ocorre a escrita no Geolog, os volumes devem ter o mesmo tamanho vertical de pixels para evitar falhas no dado.

Video: Importação e exportação de dados entre Geolog e GeoSlicer

Image Log Crop

O Módulo Image Log Crop permite o recorte personalizado de imagens de poço, ajustado com base nas profundidades do topo e fundo da imagem.

Painéis e sua utilização


Figura 1: A manipulação pode ser feita utilizando sliders e valores numéricos (à esquerda), ou arrastando com o mouse a região de corte sobre a imagem de poço (ao centro). Após clicar "Apply", pode-se abrir a imagem cortada e visualizá-la, como aparece na imagem à direita.

Manipulações dos sliders (à esquerda na Imagem 1) refletem-se automaticamente na região de corte (no centro da imagem) e vice-versa.

Principais opções

Input: Escolha a imagem a ser recortada.
Depth crop range (m): Limites inferior e superior da região de profundidades que constituirá o recorte, em metros.
Index crop range: Os mesmos limites acima, mas expressos em índices.
Arrastando com o mouse a região de corte sobre a imagem de poço (ao centro)

Video: Cortando uma imagem de poço

Image Log Inpaint

O Módulo Image Log Inpaint integrado ao GeoSlicer é uma ferramenta que permite realizar o preenchimento interativo de áreas ausentes ou danificadas em imagens de poço, com ajustes dinâmicos durante o processo.

Painéis e sua utilização


Figura 1: Apresentação do módulo Image Log Crop.

Principais opções

Input image: Escolha a Imagem a ser alterada. Ao escolher uma imagem, duas views serão adicionadas automaticamente para facilitar usabilidade.
Clone Volume: Cria uma nova imagem para ser utilizada no módulo, mantendo a imagem original selecionada no input sem mudanças.
Rename Volume: Renomeia o nome da imagem escolhida.
Tesoura/Scissors: Ferramenta que realiza o preenchimento: primeiro, selecione a ferramenta e, em seguida, desenhe na imagem a área onde o preenchimento deverá ser realizado. As opções da ferramenta no menu inferior são desabilitadas nesse módulo.
Setas: Permitem desfazer ou refazer uma modificação de preenchimento.

Video: Simulando a correção de um artefato em imagens de poço.

Image Generation

O módulo Multiscale Image Generation oferece uma interface com diversos parâmetros para a manipulação e configuração da biblioteca MPSlib. O MPSlib possui um conjunto de algoritmos baseados em modelos estatísticos de múltiplos pontos (MPS - Multiple point statistics) inferidos a partir de uma imagem de treinamento. Atualmente, apenas o algoritmo Generalized ENESIM com modo de amostragem direta (DS - Direct Sampling) está disponível.

Painéis e sua utilização


Figura 1: Módulo Multiscale Image Generation.

Dados de entrada

Training Image: Volume que atua como imagem de treinamento.
Hard Data Image: Volume que atua como "Hard Data", onde os valores e pontos são fixos durante a simulação.
Mask Image: Volume que atua como máscara para seleção da área de simulação. Segmentos não selecionados não serão incluídos na simulação.

Opções de simulação

Wrap HD into cylinder: Caso o "Hard Data" seja uma imagem de poço (2D), esta opção faz com que a imagem seja considerada como um cilindro e realize simulações como 3D.
Data type: Determina se o tipo de dado é contínuo ou categórico. Segmentações e Labelmaps podem ser usadas para simulações discretas e contínuas, mas volumes escalares podem ser usadas apenas para contínua.
Categórico: Segmentações controlam regiões e determinam o valor da classe do volume de Hard Data e Imagem de treinamento. Segmentos não selecionados serão desconsiderados.
Contínuo: Segmentações controlam quais regiões e valores do volume vão entrar como Hard Data ou dado de treinamento. Segmentos não selecionados serão desconsiderados.
Grid Resolution: Resolução do voxel da imagem resultante (mm).
Grid Dimensions: Dimensões da imagem resultante.
Automatic resampling: Ativa a funcionalidade de redimensionamento automático dos dados de entrada para a dimensão e resolução do grid de simulação. Caso imagem seja um imagelog, o redimensionamento do eixo Y é desabilitado.
- Spacing: Nova resolução do eixo após o redimensionamento.
- Size: Nova dimensão do eixo após o redimensionamento.
- Ratio: Razão da nova resolução do voxel para a resolução inicial.

Parâmetros

Number of Conditioning points: Número de pontos condicionantes a ser utilizado em cada iteração.
Number of realizations: Número de simulações e imagens a serem geradas.
Number of iterations: Número máximo de iterações a serem realizadas na imagem de treinamento.
Random seed: Valor usado para iniciar a simulação. Uma mesma seed com os mesmos parâmetros sempre geram o mesmo resultado.
Colocate dimensions: Para uma simulação 3D, garanta que a ordem nas últimas dimensões seja importante, permitindo uma co-simulação 2D com dados condicionais na terceira dimensão.
Max search radius: Somente dados condicionais dentro de um raio definido são usados como dados de condicionamento.
Max distance (normalized): A distância máxima que levará à aceitação de uma correspondência condicional de modelo. Se o valor for 0, será buscada uma correspondência perfeita.
Distance power: Pondera os dados de condicionamento com base na distância dos valores centrais. Valor 0 configura sem ponderação.

Opções Saída

Output prefix: Nome do volume o arquivo gerado. Em caso de múltiplas realizações, um número é adicionado para indicar a realização.
Save: Opções de formas para salvar os resultados.
First realization: Salva apenas a primeira realização como volume individual.
All realizations: Salva todas as realizações como volumes individualmente.
As sequence: Salva as realizações em um conjunto de sequence. O volume da saída "_proxy" indica ser uma sequência e possui os controladores para a visualização das realizações.
TIF files: Salva todas as realizações como arquivos tiff.
Export directory: Diretório em que os arquivos tiff serão salvos. Só é habilitado caso a opção "TIF files" esteja selecionada.

Botões

Run: Executa o mps de forma sequencial. A interface do Geoslicer é travada durante a execução dessa opção.
Run Parallel: Executa o mps de forma paralela. Nessa opção a execução é executada em outra thread e a interface pode ser usada durante a execução.
Cancel: Interrompe a execução da simulação. Apenas quando executado de forma paralela.

Video: Simulando um volume 3D a partir de uma imagem de poço

Post Processing

Módulo para extração de dados após simulação Multiscale.


Figura 1: Módulo Multiscale Post Processing.

Métodos

Porosity per Realization

Produz uma tabela com a porcentagem de porosidade de cada fatia de um volume, em todos os volumes de uma sequência.

Dados de entrada e Parâmetros

Realization volume: Volume para cálculo da porosidade. Se o volume for um proxy para uma sequência de volumes, a porosidade irá ser calculada para todos as realizações.
Training image: Volume extra incluído nos cálculos e adicionado à tabela como referência.
Pore segment Value: Valor a ser considerado como poro em volumes escalares (dado contínuo).
Pore segment: Segmento a ser considerado como poro em Labelmaps (dado discreto).

Pore Size distribution

Recalcula a distribuição do tamanho de poro para frequência.

Dados de entrada e Parâmetros

PSD Sequence Table: Tabela ou proxy de sequência de tabelas resultante do módulo Microtom.
PSD TI Table: Tabela resultado do microtom para a imagem de treinamento.

Video: Calculando porosidade por fatia para o resultado do módulo Multiscale

Fluxos Possíveis

Importação de dados e tratamentos:

Dados de Image Log:

Import: Image Log Import ou Geolog Integration
Inpaint: Preenchimento de Image Log
Spiral Filter
Crop: Recorte de Image Log
Segmentation
Image log export

Dados de MicroCT:

Import: Volumes Loader
Crop
Filter: Opções de filtros para a remoção de ruídos nas imagens microCT, facilitando a etapa de segmentação.
Segmentation
Transforms
Volumes export

Dados de CoreCT:

Import
Crop
Segmentation

Simulando com Multiscale

Preenchendo image logs com dados faltantes ou incompletos:

Importar imagem de poço: Image Log importer ou Geolog Integration.
Segmentação: Separar em camadas com dados e sem dados.
Multiscale: Mesma imagem como TI e HD, desmarcar segmento do espaço vazio.
Simulação. Resultado deve preencher apenas o espaço vazio.
Exportar dado após simulação: Image Log Export (csv, DLIS ou LAS) ou Geolog Integration.

Simulando um volume a partir de um Image Log

Importar imagem de poço (HD): Image Log importer ou Geolog Integration.
Importar Imagem de treino (TI): Volumes Loader ou multicore.
Segmentação: Segmentação das imagens é obrigatória para simulação discreta. Para dados contínuos segmentação permite controlar regiões que entraram na simulação.
Multiscale: Volume 3D como TI e imagem de poço como HD.
Simulação: Marcar a opção "Wrap cylinder". Opção marcar "Continuous Data".
Exportar dado após simulação: Volumes export (TIF, RAW e outros dados). É possível exportar resultados da simulação como TIF diretamente do módulo Multiscale Image Generation