Thin Section Flows

Fluxo PP

Este fluxo é utilizado para calcular métricas de poro a partir de uma imagem PP (polarização plana).

Video: Executando o fluxo PP/PX

Carregar PP/PX

Escolha os arquivos de imagem PP (polarizado plano) para carregar.

Módulo correspondente: Thin Section Loader

Elementos da Interface

Especifique o caminho para a imagem no campo PP.

Ao lado do campo, há um botão que abre o explorador de arquivos do sistema, a fim de selecionar o arquivo.

Formatos aceitos

• JPEG
• TIFF
• PNG

Definir a Escala

Defina o tamanho do pixel em milímetros para a imagem.

Neste passo, a imagem PP deve estar visível. Se a imagem tiver uma barra de escala, ela pode ser detectada automaticamente, e os campos serão preenchidos automaticamente. Nesse caso, confira os valores e siga para o próximo passo.

Se a detecção falhar, a seguinte mensagem aparecerá: Could not detect scale automatically. Please define it manually. Nesse caso, é necessário definir a escala manualmente. Se o tamanho do pixel for conhecido, preencha-o diretamente no campo Pixel size (mm). Se não for, o tamanho do pixel pode ser calculado medindo a barra de escala na imagem.

Definir a escala é importante para garantir que as métricas de poro calculadas posteriormente estejam fisicamente corretas.

Módulo correspondente: Thin Section Loader

Elementos da Interface

• Scale size (px): Insira o tamanho da barra de escala em pixels (px). Use o botão Measure bar para medir diretamente na imagem.

• Measure bar: Clique neste botão para usar a ferramenta de medida, que permitirá que você desenhe uma linha na imagem para medir a barra de escala em pixels. Com a ferramenta ativa, clique em uma das extremidades da barra, em seguida clique na outra extremidade. O campo Scale size (px) será preenchido com o tamanho medido.

• Scale size (mm): Insira o tamanho real da barra de escala em milímetros (mm). Esse valor deve estar visível na imagem, próximo a barra. Por exemplo, se estiver escrito "0,1 cm", insira "1" no campo.

• Pixel size (mm): Este campo exibe o valor calculado do tamanho do pixel em milímetros, com base nos valores inseridos nos campos Scale size (px) e Scale size (mm). Esse valor é atualizado automaticamente quando os campos anteriores são preenchidos.

Definir o Segmento de Interesse

Selecione o segmento de interesse (SOI) para as imagens PP/PX.

Algumas imagens podem incluir regiões que não fazem parte da rocha, em especial nas bordas. Esse passo permite definir a região relevante.

Os passos posteriores Smart-seg e Auto-label serão executados apenas nesta região.

Para definir o segmento, desenhe retângulos na imagem. Se preferir desenho livre, selecione a opção Free-form.

Módulo correspondente: Segment Editor

Elementos da Interface

Ferramentas de Segmentação

• Sem edição: Use este ícone para interagir com a visualização (zoom, mover etc) em vez de desenhar o segmento.
• Tesoura: Use este ícone para ativar a ferramenta de tesoura, usada para editar o segmento de interesse.

Opções da Tesoura

• Operações:
  • Erase inside: Apagar parte do segmento que estiver dentro da região desenhada.
  • Erase outside: Apagar parte do segmento que estiver fora da região desenhada.
  • Fill inside: Preencher segmento dentro da região desenhada.
  • Fill outside: Preencher segmento fora da região desenhada.
• Formas:
  • Free-form: Desenhar desenhos livres.
  • Circle: Desenhar círculos.
  • Rectangle: Desenhar retângulos.
• Undo/Redo: Desfazer ou refazer a última alteração.

Segmentação Inteligente

Segmente automaticamente a imagem usando um modelo de aprendizado de máquina. Se preferir segmentar a imagem manualmente, pule este passo com a opção Skip.

Módulo correspondente: Segmentação Automática (Thin Section)

Elementos da Interface

• Model: Selecione o modelo a ser usado para segmentar a imagem. Após selecionar, informações sobre o modelo aparecerão, incluindo descrição e segmentos de saída. Cada modelo segmenta a imagem em um conjunto específico de classes.

Segmentação Manual

Edite a segmentação com ferramentas manuais. Esse passo pode ser usado para editar a segmentação criada no passo anterior (Smart-seg), ou para editar uma segmentação nova.

Módulo correspondente: Segment Editor

Elementos de Interface

Página principal: Segment Editor

Auto-fragmentar

Divida a segmentação atual em vários objetos usando o método escolhido.

Escolha quais segmentos na segmentação atual dividir em objetos utilizando as caixas de seleção. Os segmentos selecionados serão considerados um só no algoritmo de fragmentação.

Módulo correspondente: Segment Inspector

Elementos da Interface

• Method: Selecione o método desejado para dividir os segmentos. As opções incluem:

  • Watershed: Divide os segmentos encontrando bacias nos valores da imagem subjacente.
  • Separate objects: Divide segmentos em regiões contíguas. Os objetos não tocarão uns aos outros.

• Segments:

  • Lista de segmentos atualmente na imagem com caixas de seleção para escolher quais devem ser divididos.
  • Cada segmento é representado por sua cor e nome.

• Calculate proportions: Caixa de seleção para habilitar ou desabilitar o cálculo das proporções dos segmentos. Se habilitado, mostra a área de cada segmento em relação à região de interesse.

Editar Objetos

Separe ou una objetos detectados no passo anterior.

Após a edição, pressione Next para recalcular as métricas de poro e gerar uma nova tabela de relatório. Pressione Skip para pular o cálculo, se não houver alterações.

Módulo correspondente: Label Editor

Elementos da Interface

Este passo mostra o mapa de objetos gerado no passo anterior (auto-label). Clique em uma operação e, em seguida, clique em um objeto na imagem para executá-la.

• Hold operation for next edition: Selecione esta opção para realizar uma operação (ex.: Merge) várias vezes consecutivas sem precisar selecionar a operação novamente.
• Merge: Clique em dois objetos para uni-los. Atalho: m.
• Auto Split: Clique para dividir automaticamente um objeto usando a técnica de watershed. Atalho: a.
• Slice: Clique para cortar o objeto com uma linha reta. Defina a linha com dois cliques na imagem. Atalho: s.
• Point cut: Clique para cortar o objeto em um ponto específico. Atalho: c.
• Cancel: Clique para cancelar a operação atual.
• Undo: Clique para desfazer a última ação. Atalho: z.
• Redo: Clique para refazer a última ação desfeita. Atalho: x.

Finalizar

Este passo apresenta os resultados do fluxo de trabalho. Todas imagens do projeto são listadas, incluindo entradas, saídas e imagens intermediárias.

Ao finalizar o fluxo, você pode:

• Visualizar os resultados (Clique no ícone de olho na lista de resultados)
• Salvar o projeto (Ctrl+S)
• Exportar os resultados usando o módulo Thin Section Export
• Clicar em Next para executar o fluxo com outra imagem.

Módulo correspondente: Explorer

Elementos da Interface

Todos os dados do projeto atual são listados, isso inclui tanto dados gerados neste fluxo ou em outros processos.

O relatório é gerado no passo Auto-label e é recalculado opcionalmente no passo Edit labels. Ambas tabelas são listadas. O mesmo vale para o mapa de objetos (labelmap).

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Fluxo PP/PX

Este fluxo é utilizado para calcular métricas de poro a partir de uma imagem PP (polarização plana) e uma imagem PX (polarização cruzada).

Video: Executando o fluxo PP/PX

Carregar PP/PX

Escolha os arquivos de imagem PP (polarizado plano) e PX (polarizado cruzado) para carregar.

Módulo correspondente: Thin Section Loader

Elementos da Interface

Especifique o caminho para as imagens nos campos PP e PX.

Ao lado de cada campo, há um botão que abre o explorador de arquivos do sistema, a fim de selecionar o arquivo.

Formatos aceitos

• JPEG
• TIFF
• PNG

Definir a Escala

Defina o tamanho do pixel em milímetros para a imagem.

Neste passo, a imagem PP deve estar visível. Se a imagem tiver uma barra de escala, ela pode ser detectada automaticamente, e os campos serão preenchidos automaticamente. Nesse caso, confira os valores e siga para o próximo passo.

Se a detecção falhar, a seguinte mensagem aparecerá: Could not detect scale automatically. Please define it manually. Nesse caso, é necessário definir a escala manualmente. Se o tamanho do pixel for conhecido, preencha-o diretamente no campo Pixel size (mm). Se não for, o tamanho do pixel pode ser calculado medindo a barra de escala na imagem.

Definir a escala é importante para garantir que as métricas de poro calculadas posteriormente estejam fisicamente corretas.

Módulo correspondente: Thin Section Loader

Elementos da Interface

• Scale size (px): Insira o tamanho da barra de escala em pixels (px). Use o botão Measure bar para medir diretamente na imagem.

• Measure bar: Clique neste botão para usar a ferramenta de medida, que permitirá que você desenhe uma linha na imagem para medir a barra de escala em pixels. Com a ferramenta ativa, clique em uma das extremidades da barra, em seguida clique na outra extremidade. O campo Scale size (px) será preenchido com o tamanho medido.

• Scale size (mm): Insira o tamanho real da barra de escala em milímetros (mm). Esse valor deve estar visível na imagem, próximo a barra. Por exemplo, se estiver escrito "0,1 cm", insira "1" no campo.

• Pixel size (mm): Este campo exibe o valor calculado do tamanho do pixel em milímetros, com base nos valores inseridos nos campos Scale size (px) e Scale size (mm). Esse valor é atualizado automaticamente quando os campos anteriores são preenchidos.

Registrar

Registre a imagem PP com a imagem PX, garantindo que elas estejam espacialmente alinhadas.

Confira se as imagens precisam de alinhamento, por exemplo, usando a função Rock Se elas já estiverem alinhadas, pule esse passo com a opção Skip

Se o registro for necessário, clique no botão Add e, em seguida, clique na imagem para adicionar um marcador. Arraste o mesmo marcador na outra imagem de forma que ele esteja na mesma posição em ambas as imagens.

Adicione mais marcadores até que as imagens estejam alinhadas.

Módulo correspondente: Thin Section Registration

Elementos da Interface

Visualização

• Display:
• Fixed: Seleciona a visualização da imagem PP.
• Moving: Seleciona a visualização da imagem PX.

• Transformed: Seleciona a visualização da imagem Transformed Essa imagem mostra ambas imagens sobrepostas.

• Fade: Ajusta a opacidade entre as imagens sobrepostas. Use a barra deslizante para alterar a opacidade e o campo numérico para definir um valor específico.

• Rock: Ativa a visualização alternativa das imagens em um movimento de vai-e-vem.

• Flicker: Alterna rapidamente entre as imagens.

• Views:

• Zoom in: Aumenta o zoom na visualização de todas imagens.
• Zoom out: Reduz o zoom na visualização de todas imagens.
• Fit: Ajusta as imagens para caber na janela de visualização.

Marcadores (Landmarks)

• Add: Clique neste botão para adicionar um novo marcador na imagem.
• Lista de marcadores: Exibe os marcadores adicionados. Cada marcador listado inclui:
• Botão de seleção : Seleciona o marcador.
• Botão de exclusão : Exclui o marcador.

Definir o Segmento de Interesse

Selecione o segmento de interesse (SOI) para as imagens PP/PX.

Algumas imagens podem incluir regiões que não fazem parte da rocha, em especial nas bordas. Esse passo permite definir a região relevante.

Os passos posteriores Smart-seg e Auto-label serão executados apenas nesta região.

Para definir o segmento, desenhe retângulos na imagem. Se preferir desenho livre, selecione a opção Free-form.

Módulo correspondente: Segment Editor

Elementos da Interface

Ferramentas de Segmentação

• Sem edição: Use este ícone para interagir com a visualização (zoom, mover etc) em vez de desenhar o segmento.
• Tesoura: Use este ícone para ativar a ferramenta de tesoura, usada para editar o segmento de interesse.

Opções da Tesoura

• Operações:
  • Erase inside: Apagar parte do segmento que estiver dentro da região desenhada.
  • Erase outside: Apagar parte do segmento que estiver fora da região desenhada.
  • Fill inside: Preencher segmento dentro da região desenhada.
  • Fill outside: Preencher segmento fora da região desenhada.
• Formas:
  • Free-form: Desenhar desenhos livres.
  • Circle: Desenhar círculos.
  • Rectangle: Desenhar retângulos.
• Undo/Redo: Desfazer ou refazer a última alteração.

Segmentação Inteligente

Segmente automaticamente a imagem usando um modelo de aprendizado de máquina. Se preferir segmentar a imagem manualmente, pule este passo com a opção Skip.

Módulo correspondente: Segmentação Automática (Thin Section)

Elementos da Interface

• Model: Selecione o modelo a ser usado para segmentar a imagem. Após selecionar, informações sobre o modelo aparecerão, incluindo descrição e segmentos de saída. Cada modelo segmenta a imagem em um conjunto específico de classes.

Segmentação Manual

Edite a segmentação com ferramentas manuais. Esse passo pode ser usado para editar a segmentação criada no passo anterior (Smart-seg), ou para editar uma segmentação nova.

Módulo correspondente: Segment Editor

Elementos de Interface

Página principal: Segment Editor

Auto-fragmentar

Divida a segmentação atual em vários objetos usando o método escolhido.

Escolha quais segmentos na segmentação atual dividir em objetos utilizando as caixas de seleção. Os segmentos selecionados serão considerados um só no algoritmo de fragmentação.

Módulo correspondente: Segment Inspector

Elementos da Interface

• Method: Selecione o método desejado para dividir os segmentos. As opções incluem:

  • Watershed: Divide os segmentos encontrando bacias nos valores da imagem subjacente.
  • Separate objects: Divide segmentos em regiões contíguas. Os objetos não tocarão uns aos outros.

• Segments:

  • Lista de segmentos atualmente na imagem com caixas de seleção para escolher quais devem ser divididos.
  • Cada segmento é representado por sua cor e nome.

• Calculate proportions: Caixa de seleção para habilitar ou desabilitar o cálculo das proporções dos segmentos. Se habilitado, mostra a área de cada segmento em relação à região de interesse.

Editar Objetos

Separe ou una objetos detectados no passo anterior.

Após a edição, pressione Next para recalcular as métricas de poro e gerar uma nova tabela de relatório. Pressione Skip para pular o cálculo, se não houver alterações.

Módulo correspondente: Label Editor

Elementos da Interface

Este passo mostra o mapa de objetos gerado no passo anterior (auto-label). Clique em uma operação e, em seguida, clique em um objeto na imagem para executá-la.

• Hold operation for next edition: Selecione esta opção para realizar uma operação (ex.: Merge) várias vezes consecutivas sem precisar selecionar a operação novamente.
• Merge: Clique em dois objetos para uni-los. Atalho: m.
• Auto Split: Clique para dividir automaticamente um objeto usando a técnica de watershed. Atalho: a.
• Slice: Clique para cortar o objeto com uma linha reta. Defina a linha com dois cliques na imagem. Atalho: s.
• Point cut: Clique para cortar o objeto em um ponto específico. Atalho: c.
• Cancel: Clique para cancelar a operação atual.
• Undo: Clique para desfazer a última ação. Atalho: z.
• Redo: Clique para refazer a última ação desfeita. Atalho: x.

Finalizar

Este passo apresenta os resultados do fluxo de trabalho. Todas imagens do projeto são listadas, incluindo entradas, saídas e imagens intermediárias.

Ao finalizar o fluxo, você pode:

• Visualizar os resultados (Clique no ícone de olho na lista de resultados)
• Salvar o projeto (Ctrl+S)
• Exportar os resultados usando o módulo Thin Section Export
• Clicar em Next para executar o fluxo com outra imagem.

Módulo correspondente: Explorer

Elementos da Interface

Todos os dados do projeto atual são listados, isso inclui tanto dados gerados neste fluxo ou em outros processos.

O relatório é gerado no passo Auto-label e é recalculado opcionalmente no passo Edit labels. Ambas tabelas são listadas. O mesmo vale para o mapa de objetos (labelmap).

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Fluxo QEMSCAN

Este fluxo é utilizado para calcular métricas de poro a partir de uma imagem QEMSCAN.

Video: Executando o fluxo QEMSCAN

Carregar QEMSCAN

Escolha o arquivo de imagem QEMSCAN a ser carregado.

Módulo correspondente: QEMSCAN Loader

Elementos da Interface

• QEMSCAN file Especifique o caminho para a imagem QEMSCAN.

Ao lado deste campo, há um botão que abre o explorador de arquivos do sistema, a fim de selecionar o arquivo.

Se houver um único arquivo CSV na mesma pasta da imagem, este será usado para definir o nome e a cor de cada segmento da imagem. Se não houver, é usada uma tabela padrão QEMSCAN.

• Pixel size (mm)

Especifique o tamanho de cada pixel da imagem em milímetros.

Formatos aceitos

• TIFF (imagem)
• CSV (tabela de cores)

Definir o Segmento de Interesse

Selecione o segmento de interesse (SOI) para as imagens PP/PX.

Algumas imagens podem incluir regiões que não fazem parte da rocha, em especial nas bordas. Esse passo permite definir a região relevante.

Os passos posteriores Smart-seg e Auto-label serão executados apenas nesta região.

Para definir o segmento, desenhe retângulos na imagem. Se preferir desenho livre, selecione a opção Free-form.

Módulo correspondente: Segment Editor

Elementos da Interface

Ferramentas de Segmentação

• Sem edição: Use este ícone para interagir com a visualização (zoom, mover etc) em vez de desenhar o segmento.
• Tesoura: Use este ícone para ativar a ferramenta de tesoura, usada para editar o segmento de interesse.

Opções da Tesoura

• Operações:
  • Erase inside: Apagar parte do segmento que estiver dentro da região desenhada.
  • Erase outside: Apagar parte do segmento que estiver fora da região desenhada.
  • Fill inside: Preencher segmento dentro da região desenhada.
  • Fill outside: Preencher segmento fora da região desenhada.
• Formas:
  • Free-form: Desenhar desenhos livres.
  • Circle: Desenhar círculos.
  • Rectangle: Desenhar retângulos.
• Undo/Redo: Desfazer ou refazer a última alteração.

Auto-fragmentar

Divida a segmentação atual em vários objetos usando o método escolhido.

Escolha quais segmentos na segmentação atual dividir em objetos utilizando as caixas de seleção. Os segmentos selecionados serão considerados um só no algoritmo de fragmentação.

Módulo correspondente: Segment Inspector

Elementos da Interface

• Method: Selecione o método desejado para dividir os segmentos. As opções incluem:

  • Watershed: Divide os segmentos encontrando bacias nos valores da imagem subjacente.
  • Separate objects: Divide segmentos em regiões contíguas. Os objetos não tocarão uns aos outros.

• Segments:

  • Lista de segmentos atualmente na imagem com caixas de seleção para escolher quais devem ser divididos.
  • Cada segmento é representado por sua cor e nome.

• Calculate proportions: Caixa de seleção para habilitar ou desabilitar o cálculo das proporções dos segmentos. Se habilitado, mostra a área de cada segmento em relação à região de interesse.

Observação: como este fluxo não carrega uma foto de lâmina de referência, o algoritmo watershed usa apenas o segmento especificado como entrada.

Editar Objetos

Separe ou una objetos detectados no passo anterior.

Após a edição, pressione Next para recalcular as métricas de poro e gerar uma nova tabela de relatório. Pressione Skip para pular o cálculo, se não houver alterações.

Módulo correspondente: Label Editor

Elementos da Interface

Este passo mostra o mapa de objetos gerado no passo anterior (auto-label). Clique em uma operação e, em seguida, clique em um objeto na imagem para executá-la.

• Hold operation for next edition: Selecione esta opção para realizar uma operação (ex.: Merge) várias vezes consecutivas sem precisar selecionar a operação novamente.
• Merge: Clique em dois objetos para uni-los. Atalho: m.
• Auto Split: Clique para dividir automaticamente um objeto usando a técnica de watershed. Atalho: a.
• Slice: Clique para cortar o objeto com uma linha reta. Defina a linha com dois cliques na imagem. Atalho: s.
• Point cut: Clique para cortar o objeto em um ponto específico. Atalho: c.
• Cancel: Clique para cancelar a operação atual.
• Undo: Clique para desfazer a última ação. Atalho: z.
• Redo: Clique para refazer a última ação desfeita. Atalho: x.

Finalizar

Este passo apresenta os resultados do fluxo de trabalho. Todas imagens do projeto são listadas, incluindo entradas, saídas e imagens intermediárias.

Ao finalizar o fluxo, você pode:

• Visualizar os resultados (Clique no ícone de olho na lista de resultados)
• Salvar o projeto (Ctrl+S)
• Exportar os resultados usando o módulo Thin Section Export
• Clicar em Next para executar o fluxo com outra imagem.

Módulo correspondente: Explorer

Elementos da Interface

Todos os dados do projeto atual são listados, isso inclui tanto dados gerados neste fluxo ou em outros processos.

O relatório é gerado no passo Auto-label e é recalculado opcionalmente no passo Edit labels. Ambas tabelas são listadas. O mesmo vale para o mapa de objetos (labelmap).